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作者
刘金堂
中国科学技术大学生命科学学院生物学专业博士一年级生，主要从事肿瘤免疫学研究。
图片是一篇论文的灵魂，是作者向读者传达信息最直观、最重要的方式。在SCI论文中，无论是综述文章还是研究论文都包含大量的图表，这在生物学领域期刊中体现得淋漓尽致。综述文章中图表的目的是为了让读者更加形象、方便地了解文章中文字描述的内容，而研究论文中的图表则是为了让读者能够快速掌握文章研究问题给出的证据。一般来说，信息量大、冲击力强、可读性高应该是论文图片的特点。在研究论文中，结果部分占据了文章的主体，结果部分主要对图片进行描述和分析，可见图片在一篇论文中的重要性。近年来，论文发表对图片质量的要求越来越高，合理、美观、制作精良的图片可以大大提高论文的可读性，更容易得到期刊编辑和审稿人的认可，大大提高论文发表的成功率。
我的研究方向是肿瘤免疫学，这个领域比较好的杂志有Cell，Nature，Science，Immunity，Nature Immunology，Science Immunology等。我主要以这个领域在这些杂志上发表过的一些文章为例，讲一下SCI论文对图片制作和排版的要求。
SCI论文图像的要素
通常一篇论文由多个主图和补充图组成，每个图又由多个子图组成。这些子图主要有三种类型：实验图、数据图和模式图。实验图通常是各类实验直接得到的结果，多数为照片，是论文论证的关键依据，如组织化学、荧光、Western Blot等实验结果的展示。数据图通常是对实验得到的原始实验数据进行可视化分析得到的结果，多数为条形图、散点图、折线图等各种统计图表，还有一些更为多样、丰富多彩、信息量巨大的图表是通过生物信息学方法分析大量数据而制作的，如热图、火山图、桑基图、弦图等。模式图是作者为了方便读者理解而绘制的漫画。 例如Cell及其子期刊会有图形化摘要帮助读者了解全文内容，以及论文中出现的流程图、信号通路图、模型建立的动画等。
以2023年9月发表在Nature上的CD300ld on neutrophils is required for tumour-driven immunity suppression这篇文章为例，在一张图中，有三种类型的图片，分别是模型图片、实验图片和数据图片。作者通过模型图片明确的告诉读者如何敲除CD3001d基因，通过凝胶电泳实验图片直接告诉读者敲除小鼠构建成功，通过流式细胞术实验图片和对流数据统计得到的数据图片告诉读者KO小鼠中性粒细胞CD300ld明显被敲除。
SCI论文中的图片通常包括组成图片的子图片、子图片的排列顺序、子图片必要的英文说明以及图例信息。图片中的子图片排列顺序应按结果描述的顺序进行编号最好位图转矢量图软件，数字可以是大写或小写英文字母，排列时要保持数字横竖对齐。在排列子图片和数字时最好能保证每幅子图片都能独立剪出来。对于每张图片都要附上相应的图例信息，包括整张图片的标题、各子图片的注释，包括简要的研究方法和实验结果，以及一些缩写、特殊符号、标度等的定义和说明。另外，不同的子图片类型有不同的组成部分和制图要求。 例如，条形图中需要标明坐标轴刻度、坐标轴标签、图例说明、误差线和显著性标记（P值/*）；免疫荧光图谱中需要标明必要的文字标注、刻度标记和放大视野位置。
以2023年9月发表在Nature上的文章CD300ld on neutrophils is required for tumour-driven immunity suppression为例，图3由8个子图组成，使用小写英文字母ah按顺序排列，并包含必要的英文描述和图注信息。具体来说，图3b在免疫荧光图中显示了必要的标尺，图例中标尺长度代表100μm，图3c统计图中P值标记为P=0.0006，纵轴标记为每0.5mm2的CD8+细胞数，横轴刻度为分组信息WT和KO。整体来看，可以清晰的看到该图所传达的信息：KO组荧光场中CD8+细胞数明显高于WT组。在图3a中可以看到统计图中的图例信息，黑点代表WT，红点代表KO组。 在图例中可以看到图3的标题为：CD300ld敲除重塑肿瘤免疫抑制微环境最好位图转矢量图软件，以及每张图采用了什么方法和实验，比如图3b，通过免疫荧光检测WT和KO荷瘤小鼠CD8+T和中性粒细胞的分布情况，并在最后说明了图中缩写的含义，比如DC代表树突状细胞，TAM代表肿瘤相关巨噬细胞。
SCI论文绘图要求
期刊一般对图片的大小、格式、色彩模式、分辨率、配色、线段、字体、字号等都有要求，不同期刊的要求可能不尽相同，但大体类似。图片的格式主要有两种，位图和矢量图。位图的特点是放大后会变模糊，而且图片中的字体无法选择。通常相机拍的一些照片就是位图。SCI论文中位图的常见格式是.tiff，而矢量图可以随意放大缩小，清晰度不改变。通常统计图、图案图都是矢量图。SCI论文中矢量图的格式一般是.pdf。在矢量格式编辑过程中，一旦截屏成tiff等位图格式，矢量性质就消失了，而且是不可逆的。所以线稿在编辑过程中要一直保持矢量格式，在投稿前输出为图片。SCI论文除了对图片格式的要求外，对图片分辨率和大小也有要求。 基本分辨率要求至少为300dpi，多数期刊要求图片大小控制在10MB以内。图片过大时，可以采用LZW无损压缩的方法压缩文件大小。论文中通常看到三种大小的图片：半页（8cm）、2/3页（11.4-15cm）和整页（17cm）。通常没有高度限制，但不能太高，否则排版困难。图片中的字体通常要求为Arial或Times New Roman，两种都可以，但为保证整张图片和整篇文章的一致性，建议使用Arial字体。字号在6-12pt之间，最大不要超过14pt。子图序号最大，子图内的字体稍小。为了美观，一张图片中各子图的构图要紧凑，组间间距要均匀适当，一般为0.5cm。 对于图片中的线条，比如坐标轴上的线条、框线等，每张图片的粗细要一致统一，使用黑色，一般为1pt。大部分期刊接受RGB颜色模式的图片，只有少数期刊要求CMYK模式的图片（多用于印刷）。RGB转CMYK模式比较容易，所以建议在制作图表时使用RGB颜色模式。SCI论文越来越注重图片的配色，好的配色能大大提高读者的阅读体验。一般要求配色协调，图例上的分组设置在每张图片中要统一一致。可以学习并保存比较好期刊的高级配色图片，在自己画图时使用。
以2023年9月发表在Nature上的CD300ld on neutrophils is required for tumour-driven immunity suppression的文章为例，图片采用整版大小，图片内子图序号字体最大，内部子图字体其次，各子图字体比较均匀，各子图之间的间距合适，图片配色比较和谐。
SCI论文绘图常用软件（免疫学领域）
实验图片一般用相机拍摄，如Western Blot、免疫组化染色等，可以用PS、image J、ZEN等软件处理。对于特殊实验，如流式细胞术，可以用专业软件flowjo画图。对于数据图表，可以使用GraphPad画统计图表，对于大数据样本的可视化分析，可以用R语言画图，如热图绘制。对于模式图表，可以使用Scidraw、Figdraw等在线网站画图。对于使用多个子图对文章图片进行排版、组装，可以借助AI、PPT等。
SCI论文图像绘制常见问题
通常，在获得阳性实验结果后，应根据论文要求对数据进行处理和绘图，但往往容易在一些细节上出错，比如有些肿瘤组织照片、荧光/电镜病理照片等忘记标注刻度，Western Blot结果中蛋白大小数字与单位之间忘记留空格，写成“200kDa”而不是“200kDa”。此外，图片制作排版过程中也有很多容易出错的地方。图片中组别的顺序和颜色表示在各子图和全文图片中应保持一致。一般来说，应先显示对照组，后显示实验组。对研究对象或治疗方法的描述也应在全文中保持一致。例如，如果文章中的对照组是PBS处理，则前一张图片不能命名为“Ctrl”，后一张图片不能命名为“PBS”。 全文图片内所有字体大小、格式应保持一致，如子图顺序、子图中注释、图例等。图中内容尽量保持对称，不要在图片某一区域留有过多空白。同一版式类型应保持相同的表现方式，如大小、对齐方式、图例等。
总体来说，图片质量对论文成功发表起着越来越重要的作用，漂亮精致的图片相对来说更容易成功发表。但除了图片制作细节和手法的把控，决定论文图片质量的最关键因素是制作图片的原始数据的质量和真实性。论文中图片的呈现原则主要取决于文章的逻辑性，一篇文章需要多少张图片，每张图片需要什么样的子图片，都取决于文章的整体逻辑。因此，一味追求图片质量而忽视论文本身更重要的意图、逻辑和实质性的研究内容，是本末倒置。在保证论文创新性和关键实验数据的前提下，应重视图片的制作和处理，才能发表更高水平的期刊论文。
