最近,小果作为新手开始学习机器学习,遇到了一些困难,头发也掉了不少。
终于找到解决办法了,快来看看你是否也遇到过这些问题!
本次研究主要用到了survcomp、Hmisc、survival、survivalROC、CoxBoost这五个R包,小果主要分享一下如何在Windows系统下成功安装,希望大家在这个安装步骤中少走弯路r软件教程,节省一些时间,小果会在下一期分享Ubuntu系统下的安装。
1.如果您之前没有安装过其他相关包,小果建议先安装survcomp包。
首先打开Rstudio,在终端中输入以下代码:
if (!require("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("survcomp")
由于小果没有指定安装位置,所以采用默认路径,也可以通过以下代码指定安装位置:
install.packages("package_name", lib="/path/to/custom/library")
(以下小果为默认位置,不再赘述)
等待一会儿之后就会安装完成。
您可以通过输入 library(survcomp) 来检查安装是否成功。如果软件包安装成功,则不会出现错误消息,并且软件包将被加载。如果软件包未安装,您将收到错误。
继续安装Hmisc、survival、survivalROC三个包,可以逐个安装,也可以一次性全部安装,代码如下,我们最后安装CoxBoost。
install.packages("Hmisc")
install.packages("survival")
install.packages("survivalROC")
或者
install.packages(c("Hmisc", "survival", "survivalROC"))
同样,安装完成后也可以检查是否安装成功。
1、最后我安装了CoxBoost,这个总是报错的包,导致小果掉了一半的头发。
安装此软件包之前需要做两件事。如果已经完成,您可以直接开始。
① 安装 devtools
install.packages("devtools")
② 安装Rtools
网站
打开网址下载对应版本,建议默认安装位置。
完成以上两个任务后r软件教程,您就可以开始下载CoxBoost
代码如下:
例子
library(devtools)
install_github("binderh/CoxBoost")
至此5个包安装完成,检查:
终于成功了!希望小果能给大家带来帮助!
后记:
R包那么多,难道要一个一个学?别担心,小果推出了云端生物信息学平台,只需要注册一个账号,就能满足你多样化的分析需求!这只是冰山一角~
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