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数据库介绍丨肿瘤数据库，可不只要TCGA、GEO！
想探求肿瘤数据库的丰盛资源，您无妨看看那些不太广为人知但雷同杰出且继续降级的癌症基因数据库。
以下文章将为您概括几个特征数据库，笼罩综合性肿瘤数据库、肿瘤基因组数据库、肿瘤转录组数据库。
首先，让咱们从综合性肿瘤数据库开局。
TCGA，一个环球性的钻研平台，努力于描述癌症的分子景观，提供多层面的突变图谱消息。
接着，了解另一个弱小的综合数据库COSMIC，关键关注肿瘤细胞基因组中的体细胞突变及其影响。
COSMIC不只蕴含CNA、甲基化、基因融合、SNP及基因表白消息等多种类型的数据，还经过繁复的页面设计提供易用的数据阅读。
深化探求，咱们有UCSC Cancer Genomics Browser，一个汇合了癌症基因组和临床数据剖析工具。
该平台整合了少量的数据，提供了从全基因组到特定基因的详细剖析配置。
针对肿瘤基因数据库的需求，ArrayMap是专门针对预解决肿瘤基因组芯片数据的平台，尤其长于CNA图谱的剖析。
同时，Cancer Hotspots将眼光聚焦在基因组水平的统计学关键突变上，经过可定制的选项协助用户深化钻研。
OncoKB作为片面的精准肿瘤学常识库，集结了精准医疗的多方位指南和消息，对治疗战略给予专业倡导。
若寻觅肿瘤转录组数据库，ArrayExpress提供了一站式服务，会集基因组学试验数据，允许可重复钻研。
Oncomine，则是一个专业的肿瘤基因芯片数据库，努力于搜集、剖析基因表白谱，为钻研人员提供丰盛的基因表白差异、共表白基因预测等消息，且能依据临床消息启动粗疏分类。
以上数据库导致了丰盛多元的肿瘤钻研资源网络，能够满足从基因组钻研到精准治疗各个档次的需求。
在选用数据库时，您应依据详细钻研需求，联合数据的降级性、易用性和关系钻研畛域的专业性，做出适宜的选用。
记住，高效应用这些资源，将有助于推进癌症钻研的停顿。
8+！胆碱代谢方向，构建癌症预后模型
揭秘癌症预后新方向：胆碱代谢的微妙
在最新科研成绩中，迷信家们在《Frontiers in Immunology》上提醒了胆碱代谢与结肠腺癌（COAD）预后的深入关联。经过开掘GEO和TCGA数据，他们驳回多维度剖析，如基因差异表白、GSCALite和Survival工具，聚焦于CHKB和PEMT这两大关键胆碱代谢基因。这两个基因在泛癌中的表白形式与多种癌症类型有着严密的咨询，并显示出与临床特征的清楚关系性。 精准预测的魔法棒 胆碱代谢基因模型在预测COAD的停顿和预前方面展现出了弱小的预测才干，经过明晰的列线图，为临床决策提供了有力允许。进一步的富集剖析提醒，这些基因在生殖结构发育和胶原蛋白降解环节中施展着无法或缺的作用。 免疫治疗的新线索 关系性剖析深化提醒了胆碱代谢基因与单细胞特性和免疫微环境的严密关联，它们或者成为免疫治疗畛域的新靶点，为共性化治疗战略提供了或者。特意地，钻研发现高危险COAD患者的TP53突变频率相对较低，这为了解突变形态对治疗反响的影响提供了新的视角。 化疗的得力助手 在化疗反响的评价上，胆碱代谢基因雷同体现出特殊的才干，如阿西替尼等药物的疗效预测，为临床选用最适宜的治疗打算提供了迷信依据。分子对接技术更是提醒了小分子化合物如何与指标分子协同作用，为药物设计提供了新思绪。 试验验证的实证力气 钻研者们在小鼠模型（CHKB在朝生型中上调，PEMT在COAD模型中上调）和人肠细胞（CHKB在NCM460细胞中上调，COAD细胞系中下调，PEMT则雷同）中验证了这些基因表白的灵活变动，强有力地证明了它们在COAD患者表型中的关键作用。这些发现起源于谨严的生信剖析，为未来共性化医疗提供了松软的数据允许。总结来说，胆碱代谢在COAD预后中的作用被进一步提醒，为癌症预测和治疗战略的翻新提供了关键线索。随着科研的始终深化，咱们等候更多对于胆碱代谢在不同癌症畛域中的运行发现，为环球的癌症防控带来新的打破。geo临床数据没有性别
您要问的是geo临床数据没有性别之分吗？对。
GEO是一个公共基因组学数据库，搜集了少量的基因表白数据和关系的临床数据。
在GEO中，有些临床数据没有性别消息，是由于在数据搜集和整顿环节中，由于数据隐衷包全等要素此删除了性别消息。
