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分子和物理反应具有许多性质,例如分子能量和结构、振动频率、红外和拉曼光谱、分子轨道、NMR 屏蔽和磁化率、静电势和电子密度等。估计分子性质是物理研究的重点。 而完成分子估计并不是一件容易的事。
作为世界一流的物理工具,Chem3D 软件提供了一种简单易行的分子构象估计方法。 在本节中,如何使用ChemDraw化学软件教程,我们将介绍三种使用Chem3D软件估算分子性质的方法。
模式 1:MM2 分子动力学
估测分子性质的原理是利用MM2分子动力学研究构象在一定湿度下的构象转变。
操作方法是在Chem3D草图窗口中绘制好分子构象后,通过单击Calculations菜单或Calculations工具栏上的MM2命令,快速估算分子构象在不同条件下的值。
方式二:GAMESS软件包
可以使用Chem3D软件的GAMESS软件包进行红外、拉曼和核磁共振光谱的理论模拟和预测。
操作方法是点击Calculations菜单,选择GAMESSInterface命令,然后从其子命令中分别选择PredictIR/PamanSpectrum、PredictUV/VisSpectrum或PredictNMRSpectrum。 正丙醇红外/拉曼光谱的AM1估计结果如右图所示:
正丙醇红外/拉曼光谱
温馨提示:在使用Chem3D软件估算分子构象特性之前,必须先进行构象优化。
模式 3:分子轨道拓扑图像
绘制分子轨道的拓扑图也是估计分子性质的方法之一。 具体操作方法是在构象优化后选择Chem3D软件Surfaces菜单下的ChooseSurface选项。 默认情况下化学软件教程,绘制最高抢占轨道 (HOMO)。 ,最低的未占轨道为LUMO,所以需要继续选择SelectSurface子选项SelectMolecularOrbital来选择要绘制的分子轨道,效果如下。
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Chem3D 软件概述了分子轨道
以上就是使用Chem3D软件估算三种不同分子结构的方法。 熟练掌握后有助于分析分子性质。