Aspera(ascp)软件优缺点？
优势
一个字“快”，真正的100M宽带。 SRA下载NCBI原始文件的下载速度可达100M/s。一般情况下，SRA 下载一个文件需要 15-20 分钟。大大节省时间和成本。对于云服务器的使用来说，节省时间就意味着节省金钱。
缺点
一个字“麻烦”。
首先，你必须使用linux环境。 ascp还有其他版本，但ncbi只允许下载Linux版本。这限制了大多数用户，但是对于从事生物技术的人来说这不是问题。比较Linux系统对于值得信赖的学生来说是必须的。
其次，安装过程复杂。虽然有通用的conda，但是安装起来还是不太友好。
最后，我遇到了很多未知的bug。例如下载中途停止、下载地址错误等。
Aspera安装教程
安装前请注意：Aspera 无法在 Root 下安装，必须先创建一个子用户。
#linux Centos7环境#登陆root，建立一个子用户，username是用户名useradd username#设置密码passwd usernamesu username#安装ascpwget http://download.asperasoft.com/download/sw/connect/3.7.4/aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.tar.gztar zxvf aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.tar.gzbash aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.sh#查看是否安装成功，~目录下有.aspera文件夹代表安装成功cd ~ && ls -a#添加永久环境变量echo 'export PATH=~/.aspera/connect/bin:$PATH' >> ~/.bashrcsource ~/.bashrc#测试ascp --help
有关使用 Aspera 的问答
1.如何下载SRA文件？
一定要在你之前安装的子用户下使用！ ！ ！
以下代码是下载SRR5907429.sra文件
#下载文件代码如下ascp -v -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh -k 1 -T \anonftp@ftp.ncbi.nlm.nih.gov:/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/SRR/SRR590/SRR5907429/SRR5907429.sra \./
这里需要对上面的代码片段进行解释。
2号线，无需换线
3号线，
anonftp@ftp.ncbi.nlm.nih.gov:/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/SRR/SRR590/SRR5907429/SRR5907429.sra
黄色标记的部分需要根据sra文件的名称进行更改。前六位数字非常重要。我想你看注释就能注意到这一点。
第4行是下载的目标文件夹。 “./”表示下载到当前文件夹。
2、下载提示链接错误怎么办？
NCBI 最近更改了公共下载的用户名和链接，即
anonftp@ftp.ncbi.nlm.nih.gov
现在可以在此处下载该命令。这是从ncbi官网的描述文件中获取的。今后站长会及时发布更新。
3、下载速度不是100M/s是怎么回事？
站长asp服务软件，我一直在用国内的网站。云服务器和本地服务都已使用。
云服务器选择收费1M或2M宽带，速度可达30-50M/s。如果增加带宽就无法增加，但是这个速度是可以接受的。
本地服务器为家庭电信100M宽带，单次连接速度80-90M/s。
本地使用时需要注意的事项是：
1）路由器。路由器站长选择了小米路由器pro（不带硬盘）。高速下载后发现路由器的CPU始终为100%，路由器过热。这将导致路由器重新启动以保护自身。所以高速下载时，最好保持开着空调降温。
2）公共IP。一般家庭宽带是连接到住宅楼主干道上的，而不是公网IP。当你之前没有获得外部IP时，速度会打折扣。联系电信更改公网IP后才达到80-90M/s的速度。
3）下载前请务必计算好存储空间。一般情况下，下载都是分批进行的。下载解压后，文件大小很大，一般是3-4倍。如果空间不足，程序将自动停止。不过ascp支持断点续传，同一个文件夹下的下载会从上次继续进行。
关于自己购买和配置服务器，可以参考站长之前写的指南；
还有一件事……
1、站长翻看了自己之前写的教程，发现有很多需要更新的地方。以后我会把这一年来的一些使用心得和Q&A贴出来，可以帮助我和大家总结。
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