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生物与基础医学领域必备软件指南:从RASMOL到CrystInfo的全方位解析

作者:软荐小编      2025-02-08 10:02:08     162

质粒图谱文件在哪找_质粒图谱绘制 软件_绘制图谱质粒软件哪个好

如果从事生物学和基础医学的学生了解生命科学领域的所有软件,那么他们肯定会以一半的努力取得两倍。如果您不了解这些事情,那么我会一一告诉您。

下面有很多内容。通常,您可以作为目录收集下面的内容,并将其用作工具词典。

让我们来谈谈一个长话短说,并说明这一点。

1。三维分子类

拉斯尔:观看生物分子3D微观立体声结构

Rastop:Rasmol 2.7.1的图形用户界面软件

铃声:直接在浏览器中观看3D分子

MOLMOL:以PDB格式将蛋白质文件存储到普通图形文件中

Raswin.exe.gz:Rasmol(Win)2.7.0.1

Rasmol新版本和中文版本

Crystinfo:习惯于快速轻松地构建,观察和检查Crystal 3D结构

PDViewer:PDB格式文件的查看器

Weblab Viewlite:3D分子浏览工具和大量分子文件的示例

Weblab ViewerPro:3D分子浏览工具

ICMLITE:3D分子浏览工具,具有其他软件没有的某些功能。

VMD:3D分子浏览工具,可以执行动态显示

CN3D:3D分子结构观察软件

WPDB:PDB文件搜索显示分析软件

DTMM:3D分子模型显示,编辑和施工程序

痣:高性能大分子3D图形显示计算工具

gopenmol:显示和分析分子结构及其特性

POV-Rayv:3D图像生成工具软件

MOLPOV:将PDB文件转换为POV格式文件的软件

mol2mol:分子文件格式转换软件

POVCHEM:将PDB文件转换为POV格式文件

窗户的Ortep-3:生成分子的热椭圆点图

柏拉图:一般晶体学软件工具

法师:用于阅读和演示Kinemage格式文件的专用软件

Prekin:将PDB格式文件转换为Kinemage格式文件

瑞士-PDB查看器:PDB文件显示和分析软件

Dinamo:蛋白质序列排队比较编辑和3D模型构建工具

PCMoleeule2 Lite:免费软件查看PDB格式文件

Struked:化学分子编辑和3D模型生成软件

JMVC:使用Java技术编写的3D分子查看器

评论:阅读和分析XYZ格式三维分子文件

OSCAIL:用于处理,定义和检查小分子单晶的软件包

Moilin:分子结构和观察软件

修补匠:用Moilin的DOS下的分子设计建模

生物设计器:自由分子建模和显示软件

Molucad:全功能分子建模和显示工具软件

查看器ActiveX控制:3D分子显示控制

Marvinview:用Java语言编写的化学分子的二维和三维显示程序

ISIS的ACD/3D查看器:免费ISISDRAW 3D显示插件

Amira:高级3D显示建模系统

杏仁醇:Amira 2.3显示三维分子的相应增强工具

可视化:分子建模和研究软件包

ScientificGl:C ++ OpenGlapi

三维分子开发工具

Sojourner:软件以找出小蛋白质的最低能量配置并实时证明

2.DNA分析

DNACLUB:DNA处理软件

JAMBW:分子生物学软件包

DNATOOL:全面的DNA序列分析工具包

pDraw:DNA分析和绘图软件,可以绘制线性或圆形DNA图

Annhyb:帮助PCR引物设计和基因探针设计的软件

限制分析:限制酶消化工具

Abiview:ABI格式文件显示和编辑软件

Chromas:ABI格式文件显示和编辑软件

序列查看器:从

GSDB及其相关属性获得的DNA序列数据的工具

DNASSIST:DNA序列分析工具

DNAPROBE:核苷酸序列设计工具

DNASP:DNA序列种群遗传分析软件

DFW:DNA分析软件

Artemis R4:用Java语言编写的序列查看工具

ACT R1:以Java语言编写的序列比较查看器

GDA:主要用于进行不连续基因数据的统计分析

RDP:从一组排队比较(对齐)核酸序列中找到潜在的重组软件

Sequencher:组装DNA小片段是大连续序列或连续的(序列)组“重对”软件

Mehcalc:Excel电子表格宏软件,该软件自动计算DNA序列热力学数据

Gene Explorer:中国界面的功能积分,有效且快速的基因分析软件

支持者:DNA蛋白结合位点预测识别软件

Matind和Matlspector:用于快速与已知共识序列快速匹配的DNA序列的软件工具

gbuilder:Java语言编写的软件以分析和显示DNA序列

Genomepepixelizer:有助于了解基因组中簇基因(C1usterMgge)之间关系的软件

实验室基因组XML查看器:用于图形显示和处理GenBank序列数据的免费软件

基因约束套件2:在克隆策略中管理和显示分子构造过程软件

归因:一种用于比较基因组或大量基因序列的工具软件

3。RNA分析

RNADRAW:RNA二级结构分析软件

RNAbstructure:预测RNA级结构图

RNAVIZ:RNA二级结构图映射程序

4。蛋白质分析

Antheprot:蛋白质序列分析软件包

PSAAM:蛋白质序列分析软件包

VHMPT:螺旋膜蛋白的拓扑观察和编辑软件

Aminoxpress:免费的多功能蛋白质分析软件软件包

5。生物化学教学

MMMP.ZIP:以图的形式表达生化代谢中的各种途径

linpath.zip:线性酶反应模拟软件

PROTLAB:蛋白质纯化仿真软件

molmed.zip:生化基本概念演示教学计划

生物化学:生物化学教学文件

照片:光合作用教学程序

肾上腺素:肾上腺素在肝糖原代谢中的作用的演示

虚拟细胞实验室:多媒体细胞生物学教学程序

6。生化工程

brd.zip:生物反应器(发酵罐)设计软件

Biostat:Biostatb发酵罐控制程序

Pensimv:青霉素发酵模拟软件

Bioprosim:实时发酵模拟软件

7。序列格式转换

访问:序列输入分析和格式转换软件

forcon:多序列文件格式转换软件

Seqverter:序列格式转换软件

Genestudio le版本:序列格式显示,编辑和转换工具软件

Fasta/Blast扫描:Fasta和

爆炸查询输出文件处理软件

REVCOMP:序列格式转换软件

8。底漆分析

底漆Premier 5.0:底漆设计工具

Oligo:著名的引物分析软件

底漆设计师:特殊使用

pask-iba〜ppr-iba表达式矢量免费底漆设计助手软件

阵列设计师:DNA和寡核苷酸引物工具的批处理设计

信标设计师:PCR定量分析分子标准设计软件

NetPrimer:基于Web界面的底漆设计程序

9。综合序列分析

PCGENE:分子生物应用软件

金刚鹦鹉:多序列构建和分析软件

Clustal W:用于比较核酸和蛋白质序列多个序列的软件

Clustal X:ClustalWindows接口程序

FASTA:用于在数据库中查找同源序列的软件

GenEDOC:对序列进行相关分析和其他操作

BLAST和BLASTCL3:用于在数据库中查找类似序列的软件和客户端软件

SEQPUP 0.9:生物分子序列编辑和分析软件

K-静态器5.5:进化遗传学研究软件质粒图谱绘制 软件,评估两个核苷酸序列中的核苷酸取代的数量

Bioedit:序列编辑和分析工具软件

DAMBE:综合序列工具软件

Lasergene:综合序列工具软件

海景:图形多序列队列编辑器

Jalview:用Java语言编写的多序列队列编辑器

DNASIS:综合序列分析工具

基因学表达:它是DNA和蛋白质序列分析工具

矢量ntiviewer:运营商查看软件

水母:多功能序列分析软件

Proseq:核酸序列编辑和种群遗传分析软件

GAP4数据库查看器:GAP4基因组装数据库阅读和显示软件

SMS:用于DNA和蛋白质序列分析和格式的在线工具的集合

OMIGA:核酸和蛋白质序列的综合分析软件

Staden:综合序列分析工具包

载体ntisuite:综合蛋白质核酸分析工具包

INCA:用Java脚本语言编写的Blast Server客户端程序

ISYS:一个用于几种不同类型的生物信息软件和数据库的软件收集平台,该平台用NCGR开发的Java语言编写

DNA scriptor:DNA和蛋白质序列的综合分析软件

序列Quickie-calc:非常紧凑的分子生物学工具软件

系统学家:用于显示基因与蛋白质序列之间的进化关系的软件,与研究相似

10。进化树分析

PHYLIP:进化树分析软件,可以画出进化树

树景:进化树处理软件

遗传:比较基因和种系进化树的程序

NDE:用于编辑Nexus格式文件的程序

Treemap:一个用于视觉上比较主和从属进化树的程序

频谱:分析进化信息而无需转换为进化树的软件

Phyltools:用于计算和处理演化树数据的软件

树嘴:核酸序列和蛋白质序列相似性分析和进化树建筑工具

ATV:用Evolutionary树文件软件编写的Java语言,该软件以NHX格式显示“ New Hampshire”

treecon:建筑和绘制进化树的包裹

概率比较表型分类数据以及分析和计算核酸序列数据的距离值

11。质粒图

质粒处理器:质粒映射软件

质粒加工物:质粒映射软件,该软件与质粒处理器是同一作者

WINPLAS:质粒绘图软件的商业版本

DMUP:环形质粒绘图软件测试版本

质粒工具包:质粒映射软件

pDraw:DNA分析和绘图软件,可以绘制线性或圆形DNA图

Redasoft Visual Cloning:这是著名的Redasoft质粒1.1软件的升级版本

SimVector:质粒图绘图软件

12。图像处理

图像工具:科学使用的图像处理软件

图像J:用Java语言编写的科学使用的图像处理软件

跨检查器:基因指纹分析软件

Alfmap:Alf(Amersham

Pharmacia)图像格式转换软件

乐队负责人:凝胶图像处理软件

Scion Lmage:图像处理和分析工具

Osiris:一般医学图像处理和分析软件

Melanie 3观众:免费

梅兰妮图像查看器

智能抽奖:流程图绘图软件的演示版本

Gimpwin:免费图像处理软件

Chromozoom:两个图像之间的相似性和差异的比较

Bandscan:蛋白质凝胶电泳图像分析软件

SigmasCanpro:图像分析软件30

天昆功能演示版本

Sigmagel:凝胶图像分析软件

Totallab:图像分析软件

LablMage:凝胶图像分析软件

Geldiff:Java软件定量比较两个2D凝胶图像之间的差异

计时:用于分析蛋白质/基因表达图的时间序列的Java软件

Quantiscan:使用简单而专业的凝胶扫描和分析软件

pdquest:用于分析二维凝胶和生成数据库的标准软件

13。数据处理

CurveExpert:ELISA标准曲线拟合的软件

CLIEKH图:实验数据图软件

Statistica:专业统计软件

GraphPad Prism:一种著名的数据处理软件

NOSA:中国非典型统计分析系统

跨图:多元数据库图形显示软件

SIGMAPLOT:图纸和数据分析软件包的30天全功能评估版本

Systat:用于数据统计分析和绘图的30天全功能演示版本

SIGMASTAT:30天的全功能演示版的智能统计软件

PeakFit:非线性数据软件的自动分离,拟合和分析

tablecurve:自动二维曲线拟合和经验公式搜索软件

tablecurve:自动3D表面拟合和经验公式搜索软件

SPSS:非常权威和著名的数据统计处理软件

30天的全功能演示版本

来源:易于使用的科学使用的数据图和数据分析处理工具软件

DATB:用于生物曲线拟合和数据分析的免费软件

数据映射助手:用于数据分析和实验结果映射的专业软件

14.搜索和阅读

Attentin:辅助软件,用于向美国国家专利商标局提交连续专利

Checker:用于向美国国家专利商标办公室提交连续专利的辅助软件

ICA32T.EXE:中国生物学文献数据库检索客户软件

PathDB搜索程序:(代谢途径数据库)搜索程序

PubCrawler:Medline文献库和GenBank核酸序列库搜索软件

Netrosebrowser:PDG格式浏览器

图书快递:专门用于下载Chaoxing数字书籍的工具软件

endnote:专业参考搜索软件

参考经理:专业参考搜索软件

Procite:参考检索管理软件

亮片:数据库GenBank,EMBL,DDBJ查询软件

缩影器:数字查看器

Compresslt:JBG(NLC)“ JPG转换功能软件

参考:参考管理软件

学者援助:用于日常信息的软件,例如参考材料

文书工作:免费参考管理软件

KD:知识仓库仓库建筑管理系统

15。基因芯片

Amada:用于组织,研究,展示和分析微阵列

(微阵列)数据软件

Scanalyze:Macromomatrix荧光图像分析软件

群集:用于分析和处理大量Macromomatrix数据组的软件

TreeView:使用图形显示群集软件分析软件的结果

AMAD:微阵列数据库

Arraymakerv:斯坦福大学布朗实验室提供的完整基因芯片研究设备的软件和文档

J-Express:分析微质体

(微阵列)用于实验获得的基因表达数据的软件

16。其他功能软件

数字化器:可以将曲线图转换为数据和方程的图形数字化软件

图形纸:坐标纸打印软件

DYNAFIT:酶动力学数据或配体受体结合数据处理软件

迁移:从遗传角度估算人口移民率的程序

Arlequin:人口遗传学软件

正交设计助理:正交实验设计辅助工具软件

FBAT:家庭遗传关联测试的统计程序

GGT32:图形基因型表示软件

Cervus:使用共同主导标签数据推断亲属关系的软件

JARNAC:代谢过程仿真软件包

GEPASI:动力学和生化反应的仿真和优化软件

BCT:微生物趋势模拟计划

Stochsim:随机生化反应模拟软件

BIO_MW:生化分子量计算软件

匹配码:仅匹配和格式化蛋白质和核酸序列的中国软件

地图管理器:用于分析遗传学映射的软件

MORECO:用于评估使用遗传方法评估无序交配频率的软件

画布:绘图软件

免疫房间管理系统:中国免疫室综合软件

西里尔:家谱图软件

冷冻细胞库存监视器:用于管理生物样品(例如细胞系,血清等)的程序,存储在液氮容器中

小鼠:虚拟动物喂养设施,以帮助管理喂养设施的实验动物软件

DBSLOVE:代谢和酶受体结合模拟软件

Boxit:用于管理生物样品的数据库系统

GRR:谱系错误的检测

(分类器)应用程序软件

Health Pharmaceuticals:药典软件

ACEDB:基因组数据库软件

MAPL98,DIAL98和GEST98:EL该学者编写的几种统计遗传学软件

PED:谱系绘图软件

PEDRAW:谱系绘图软件

定量:内置宏观计划以协助定量

RT-PCR实验的Excel文件

Bateview:管理和跟踪小型实验小鼠生殖种群

Excel文件

MassXpert:帮助科学家预测和分析蛋白质组学研究获得的蛋白质质谱数据的软件

Mestre-C和Mestre-CND:用于分析,显示和模拟1D和2D磁共振图的软件

ACD/Specviewer:免费光谱数据显示软件

ACD/CNMR查看器:ACD/HNMR用于显示ACD/NMR预测指标预测的绘制化学结构公式

查看器:用于磁共振图文件的免费软件

赢家:用于分析流式细胞仪数据文件的免费软件

TestDNA:基于已知成分值生成细胞周期

FCS文件的免费工具软件

Cylchred:细胞周期分析

(细胞分离分析)软件

GX-Path Vision:用于生成,编辑和显示生物代谢途径的工具软件

生物学Wubi:生物医学主要输入法

17。化学图

ACD/Chemsketch:绘制分子结构及其中文版本的免费软件

ACD/Chemsketch和Chembasic:用于绘制分子结构及其中文版本的免费软件5.0版本

Chemfont:化学符号和胸膜字体,可以直接插入文章中

剪辑:化学图片收集,包含近400个与化学相关的GIF图片

ISIS抽奖:用于绘制化学结构公式的免费软件

自主:ISIS/Draw软件插件(自动生成符合符合性

IUPAC命名规则复合名称)

Chemwindows:用于绘制化学结构公式的免费软件

Marvinsketch:用Java语言编写的紧凑且易于使用的化学结构绘图程序

ACD/结构图小程序:用于绘制化学结构的免费Java小程序

Chempen:用于绘制化学结构公式的软件

Chempen+:用于绘制化学结构公式的软件

Chempen:用于绘制化学结构公式的软件

18。化学应用

mmcalc.exe:分子量计算器

HXFC.ZIP:化学方程式水平软件

CMCALC10.EXE:化学试剂制备计算器

Alkne.exe:有机化学命名练习计划

Chembl32.zip:Windows 95

自由化学方程式级别计划

周期性zip:元素周期表

ptab32.zip:高级元素元素表

CAF:计算机辅助配方软件

CFT:化学配方奶

元素房屋:用于查询112个元素各种信息的中国软件

化学反应方程编辑器:制作化学反应方程,离子方程,分子公式,离子公式等。

CRS:化学反应方程式光栅

型号Chemlabv:化学实验教育软件和中文版本

周期性:exe:免费元素元素表

电子化学手册:一本综合化学手册

19。在线综合工具

生物学工作台:基于网络的生物学的综合工具

下水道:一系列常用在线工具,本地版本

20。在线蛋白质工具

BCM搜索启动器:一个用于预测蛋白质序列二级结构的综合站点

DAS:蛋白质跨膜预测服务器,输入蛋白序列,预测跨膜区域

顶点:蛋白质预测服务器提供的膜蛋白质拓扑预测的在线工具

SOSUI:膜蛋白分类和二级结构预测的在线工具

PSIPRED-MEMSAT:产生二级结构预测和跨膜拓扑结构预测

HMMTOP:用于预测跨膜螺旋和蛋白质序列拓扑结构的服务器

SMART:提供蛋白质序列,查询/显示其域和跨膜区域,以域数据库等。

TMPRED:预测蛋白序列跨膜区域

TMHMM:预测蛋白质的跨膜螺旋

预测蛋白服务器:为蛋白质数据库查询提供服务并预测各种蛋白质结构。

拆分:膜蛋白二级结构预测服务器

PRED-TMR:提供基于瑞士语数据库统计分析的蛋白质跨膜片段来预测蛋白质跨膜片段的服务

Coprethi:基于Internet的Java计划,以预测蛋白质的跨膜区域

TMAP:提供预测蛋白质跨膜片段的服务

21.RNA分析

模式搜索和发现:巴斯德研究所提供的常见RNA在线分析工具

DNA序列分析:巴斯德研究所提供的常见特征序列查询工具

搜索基因和编码区:巴斯德研究所提供的常用DNA在线分析工具

寡核苷酸计算器:巴斯德研究所提供的基因和编码区域搜索工具

铣削温度计算器:用Java语言编写的寡核苷酸计算器给出核酸序列质粒图谱绘制 软件,计算GC百分比,熔化温度,长度和分子量。可以下载并用作小计算器

BCMGENE-FINDER:核酸序列搜索服务器,提交核酸序列,选择相应的数据库并执行序列搜索

22。在线底漆设计

引物发电机:在线底漆设计程序

Prime3:一个更著名的在线入门设计计划

亮片:数据库GenBank,EMBL,DDBJ查询软件

缩影器:数字查看器

Compresslt:JBG(NLC)“ JPG转换功能软件

参考:参考管理软件

学者援助:用于日常信息的软件,例如参考材料

文书工作:免费参考管理软件

KD:知识仓库仓库建筑管理系统

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