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做生物信息学百款软件:2014尝试多组学

作者:软荐小编      2023-10-09 22:09:17     218

最近,一些微信好友说我变了,不再像五六年前那样“乐于助人”。

事实上,自从我整理和分享生物信息学领域的知识以来,已经有七年了。 我曾经是英雄,但现在我变成了龙开龙软件教程,所以我可能会在网络上受到攻击。

2013年使用过的软件分类

生物信息学软件最重要的步骤有 4 个步骤:

刚进入生物信息学领域的时候吃了不少苦头,所以把自己的经验整理出来分享给大家。 另外,我还特意尝试了不同的软件。 每个软件我自己都用过,并写下了笔记。 我为自己在数百种生物信息学软件上取得的成就感到自豪:

Web-app: webGO/David/SMS2/ExPaSy/ iPathwayGuide/
Basic: DNAman/bioEDIT/mega/clustalw/blast/blast++/fastqc/SRA-toolkit/SolexaQA/NGS-QC-toolkit/bedtools/circos/cytoscape/Emboss/ cutadapt/fastx/
Snp-calling: BWA/Bowtie2/samtools/picard/GATK/varscan/freebayes/bcftools/annovar/samStat/snpEFF/VEP/
RNA-seq: RseQC/tophat2/STAR/Hisat/htseq/cufflinks/cummedund/edgeR/DeSeq/Trinity/TransDecoder/GMAP
Evolution: muscle/figtree/PhyML/seq2HLA/Plink/
Other: LiftOver/ PICNIC/mutsig/Matlab MCR/tRNAscan-SE/FLASH/igBlast/IGV
R语言软件包:GEOquery/affy/limma/ GOstats/ConsensusClusterPlus/SPIA/ seqinr/ AnnotationHub/biostring/ GEOmetadb/biomaRt/ DawnRank

2014 年尝试多组学

其实我没有什么其他的组学话题,只是因为QQ群里的网友有各种需求,在我的QQ群里提问。 作为组长,我不好意思不知道,于是我查阅了国内外各种生物信息学资源,主动学习多组学技术:

记得我和刚到水产所的师妹一起整理了24个资源,分享在“生物新秀群”的QQ群里,供大家学习。 也正是因为需要网友的帮助,才被迫学习各种ngs组学,所以我给自己起了一个响亮的光环:全网第一全栈生物技术工程师,专业领域包括但不限于仅限于 :

2015年尝试肿瘤医学交流

2015年是一个非常关键的时期。 工作一年多后,我主动跳槽。 我开始月薪过万,进入医学领域从事肿瘤相关研究。 以前的“博信新秀群”QQ群已经不能满足我日常的工作交流需求了。 我开始组建交流小组,这导致自然过渡到像“Bioxin技能树”这样的平台,涵盖生物信息学。 各方面的应用。

2016年尝试数据挖掘

我最初开始做数据挖掘教程是因为QQ群。 很多人问如何在这样那样的文档中制作图表。 我注意到了这个需求,因为大家提出的文档其实都非常相似,而且对我们来说非常有用。 对于工程师来说,这一切都非常简单。

大约有100人响应我的众筹活动,每人支付100元加入听课群。 我一共上过10节课:

分享的所有内容都在 Bilibili 和 GitHub 上。 目录如下:

后来随着公众号的建立,这个系列教程被整理成了表达芯片公共数据库挖掘的系列推文。 有兴趣的也可以看看;

2017年-南北战争

到了2017年,我的生物技术技能树已经家喻户晓,各种商机也纷至沓来。 我到几所大学开过小讲堂,也给一些商业机构当过讲师,赚了几十万的血汗钱。

这是我第一次创办公司、组建团队,但因为想法不同而草草结束。

2018年化身为龙

凭着经验,我碰巧看到我们澳门大学对面的珠海横琴新区有很好的创业政策,所以我很自然地开了一个小工作室,并有了我的第一个全职讲师和秘书,尽管他们现在已经辞职了。

开始招学徒,培训一个月,1万元,每次培训2-3人,整理自己的NGS技能,把学徒的教学过程记录成视频。 后来我有了自己的视频编辑器,我和B站的运营商一起将所有视频免费上传到B站。这些NGS数据处理视频课程的微信交流群包括以下内容:

一定是从那时起,我不再像以前那样热情,无偿地帮助所有粉丝。 毕竟有人花钱来听我的课,这已经占用了我太多的时间和精力。 更别说我能不能抽出时间来帮助大家了。 即使我这样做了,对于那些付费的朋友来说也没有任何用处。 很公平。

2019龙行旅游

由于我录制了大量的NGS教学视频课程,也引起了全国各大高校生物信息学爱好者的关注。 我们的“生物信息学技能树”公众号邀请我参观他们的城市,包括:

2020年邪龙变强

2019年即将结束,我们还在为来年如何安排30个城市的巡回讲座而发愁。 毕竟全国各地的粉丝都热切期待我们去你们的城市交流生物信息学数据处理技术。 没想到,突如其来的疫情让所有的脚步都停了下来。

我去过北京、上海、广州、深圳、杭州、武汉、西安、长沙、郑州、南宁、福州。 那些欢笑、那些美食、那些文化依然萦绕在我的脑海里。 幸运的是,科学技术的进步保留了我们沟通的愿望。 在受到疫情短暂影响两个月后,我们顺应时代潮流,成功将热门入门全球听力课程内容升级至60小时。

为期一个月的在线直播互动课程也在一片掌声中持续了一年,足足十二节。 报名优惠如下:

期待新英雄

很多时候,帮助你对我来说可能真的很容易。 比如,如果你认识我,就发两个gse链接给我,让我帮忙下载:

软件教程app_教程网app_开龙软件教程

不会占用我很多数据,然后上传到腾讯微云或者百度传给你。 但如果我们没有友谊,我为什么要花三到五分钟为你做这件事?

再比如,我看到很多朋友在微信朋友圈转发各种公众号就是为了索要北大生物信息学公开课之类的资源,这显然是完全公开的资源,我也懒得提醒他们。

再比如,一个很简单的打印功能技巧,如果这个粉丝没有直接扔给我一个100元的红包,我很可能会因为其他事情而分心而错过他的答案。 我相信大多数粉丝肯定无法理解我有多忙开龙软件教程,他们肯定会认为我只是贪图钱财。 又或许,我就是这样的一条龙!

诸如此类的事情还有无数。 我能够像今天一样毫不费力地解决大多数粉丝的帮助请求,但这是一段坎坷的旅程。 走着走着,我慢慢忘记了自己的初衷,不惜一切代价也做不到。 我去帮助每一位向我求助的粉丝。

但是,如果有新的英雄,比如还在读本科的你,对生物信息学的大方向还很迷茫,我有无数的生物信息学资源供你成为英雄。

你会考虑走我的路吗?

欢迎留言讨论!

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