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作为科研狗,我们不仅要会做实验还要会作图!

作者:软荐小编      2023-11-11 01:02:49     233

作为科研狗,我们不仅要会做实验,还要会画画! 如今,各大知名期刊对文章配图的要求越来越严格,精美甚至炫酷的图片已经成为论文的标配。

一张图片胜过千言万语! 一张好看的图片不仅能体现作者的作图和科研水平,还能不断冲击编辑和审稿人的注意力作图软件,影响论文的整体质量以及最终能否被目标期刊接受。

道理大家都懂,但是说到科研绘图,相信每个科研人员的第一反应都是:头疼!

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不仅要将大量的实验和统计数据清晰、系统地整合到一张图表中,而且还要美观、简单。

那么怎样才能画出“堪比高端杂志”的插画呢?

1.培养内功:充分了解自己的数据,连续、离散、单变量、多变量……

2、画草图:提前构思文章中放多少张图片,分别用来展示什么信息,坚决避免信息冗余。 对于每一张图片,选择最合适的形式进行展示,力求简洁、准确、创新,但“可读性”是前提。

3.选择自己喜欢的:对目标期刊的插画风格有一定的了解。

4.练习外在技能:掌握一个绘图软件。 工欲善其事,必先利其器。

说到高性价比的绘图软件,非GraphPad Prism莫属! !

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GraphPad Prism 软件的最新版本是 GraphPad Prism 9.0。 它功能强大、简单易学,可以适合大多数医学科研图纸的实现。

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GraphPad Prism 9核心新特性详解

1.更高维度的数据!

Prism 9 为多元数据表带来了许多重大改进。 使用标准结构允许您分析更大的数据集并执行新的和改进的分析,并具有以下关键改进:

2. 主成分分析(PCA)

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注:上图显示了二维 PCA 的图形示例。 Prism 中的 PCA 可以对数百个变量进行分析!

有时收集的变量数量远远超过可用于研究的受试者数量。 如果你看一下基因表达研究,受试者被分为两组:治疗组和对照组,然后测量数百或数千个不同基因的表达水平。 可能有太多变量无法使模型适合数据。 然而,简单地删除一些变量而不对其进行分析可能会导致有价值的信息丢失。 选择一些变量从分析中排除只会丢弃潜在有用的信息! PCA 就是这样一种“降维”技术,可用于减少所需变量的数量,但同时从数据中消除尽可能少的信息。

Prism 9 的 PCA 还包括以下附加功能:

3. 向图表添加新维度

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气泡图可以直接从原始数据创建 - 编码符号位置(X 和 Y 坐标)、大小、填充颜色等的变量。请注意,可以使用分类(分组)变量或连续变量来定义符号颜色和大小。

在此图表中,有 100 多个国家/地区显示为单独的圆圈。 每个圆圈的X坐标代表该国的GDP(PPP),Y坐标代表出生时的平均预期寿命。 每个符号的大小与其代表的国家的人口成正比(两个最大的符号代表中国和印度)。 最后,每个符号的颜色代表该国家所在的大陆。 本例中的变量(颜色)是一个分类变量,但气泡图中的颜色也可以由连续变量定义,如下所示:

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在该图中,符号的X坐标、Y坐标和大小的定义与上例相同。 然而,该符号的颜色现在是连续的,代表该国每 1000 人的出生率。 Prism 现在还具有内置的半透明配色方案,以便可以更清楚地看到重叠的符号。

4.自动将多重比较结果添加到图表中

这就是你想要的!

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对多次配对比较进行相应分析后,只需单击按钮即可将结果自动添加到图表中。 要自定义这些线条和星号,只需再次单击工具栏的按钮即可。 如果对数据或分析进行调整,图表上显示的结果将自动更新。 但请记住,P 值只是您的发现的一方面。 不要忘记还报告效果估计(例如,95% 置信区间的平均差异!)。

5. 使用估计图更好地可视化 T 检验结果

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执行 t 检验时,Prism 现在会自动创建分析结果的估计图。 在此图表中,两组的原始数据将绘制在左侧 Y 轴上。 右侧 Y 轴绘制了组均值差异及其 95% 置信区间。 该图比仅使用 P 值提供更多信息,因为它不仅显示 95% CI 是否包含零,还显示 95% CI 的范围(如果 95% CI 包含零,则 P 值将大于 0.05如果 95% CI 不包含零,则 P 值将小于 0.05)。

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网上有很多Graphpad Prism教程,想要自学的同学可以自行搜索。 然而这些教程都存在很多问题,比如版本太旧,或者讲解不够详细等。

考虑到很多同学没有那么多时间在网上整理资料,也就是处于懒癌晚期。 为了方便大家学习,解螺旋给大家带来了这本备受好评的书籍教程。 如果你有什么不明白的,就去寻找吧!

《GraphPad Prism 学术图表》

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《GraphPadPrism学术图表》实体书

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书里有什么?

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第一章介绍

软件下载、安装、使用界面、图形修改与美化、学术图表配色、图片导出与发送等。

第2章介绍

常见学术图表的分类和精选以及软件内置的大部分统计方法。

第3章介绍

XY表以及该数据表类型支持的12种图表绘制方法,以及带有统计分析的XY表图形绘制,如相关分析、回归分析等。

第 4 章介绍

还介绍了Column的绘制方法以及该数据表类型支持的六种图表,并介绍了相关的图表绘制方法,包括t检验和方差分析,以及基于ROC曲线和Bland-Altman图的绘制例子。

第5章介绍

结合实例介绍了行列分组表(Grouped)以及该数据表类型支持的五类图表的绘制方法,以及二(三)因子方差分析。

第6章介绍

列联表(Contingency)以及该数据表类型支持的图表绘制方法。

第7章介绍

该数据表类型支持的生存表(Survival)及生存曲线绘制方法。

第8章介绍

三种类型的数据表(Parts of Whole)、多变量(Multiplevariables)和嵌套表(Nested)及其支持的图形绘制,特别是GraphPadPrism 9中新增的主成分分析和气泡图。

第9章介绍

使用 GraphPadPrism 进行绘图的高级技术,包括首选项设置、图形组合、自定义配色方案、魔棒工具、克隆和模板。

本书有6大亮点:

1.系统介绍如何使用Graphpad Prism 9,专业绘图专家!

众所周知,GraphPad Prism作为一款专业的数据处理和绘图软件,以其便捷性和专业性在学术图表绘制中发挥着重要作用。 但相比之下,目前市面上系统介绍GraphPad Prism绘图的书籍很少,有的书籍只介绍了低版本软件的一些简单功能。 不过本书主要介绍的是基于GraphPad Prism 9的学术图表绘制方法,可以说是赢在了起跑线上!

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2.学术图画方法有50多种,超全面!

本书以软件定义的8类数据表为基础,遵循“数据录入——数据分析——图表生成与美化”的顺序,结合科研实例,并采用t检验、方差分析、生存分析和主成分分析。 分析方法,介绍了散点图、气泡图、条形图、折线图、饼图、面积图等常见学术图表的绘制和美化方法,可以说,一本书在手,就能画出漂亮的图世界的图片!

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3.全面演示学术图的绘制和美化过程,可以洗洗眼睛了!

本书首先介绍了GraphPad Prism的图形生成和美化过程、学术图表配色原理和技巧、常用的学术图表类型以及软件中嵌入的大多数统计方法的选择。 内容可谓详实、环环相扣。 ,关键是这个过程非常洗眼,对狗狗的美容大有裨益!

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4.科研新手也可以效仿,太友好了! ! !

本书适合需要绘制学术图表的大学生和科研人员,也就是我,不需要具备使用GraphPad Prism的基础知识。 您只需要基本的计算机知识即可使用本书。 因此,这本书通常可以作为新手的参考书,让我按照例子画出我需要的学术图。 但说到统计分析,我需要根据自己的专业知识背景和统计知识来做出判断。 (对小白太友好了,我打算给这本书的作者写一封感谢信!)

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5、最后,本书还提供59个绘图源文件供下载。 这服务很到位!

最后,再次提醒大家,想要系统掌握科研绘图,或者想要提高绘画水平的同学作图软件,快来参加《解开螺旋》的0元送书活动吧。 一本书助你练就完整科研画“独家秘笈”!

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